RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 DOK3Q7L591 496 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NUP43Q8NFH3 380 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 COQ2Q96H96 371 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0U1RRA0 63 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MSCO60682 206 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MPIG6BO95866 241 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 G6PCP35575 357 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 STC1P52823 247 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS4P56470 323 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GNG5P63218 68 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 HHEXQ03014 270 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TLE1Q04724 770 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KIR3DS1Q14943 382 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF74Q16587 644 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ETDBQ3ZM63 59 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RPTNQ6XPR3 784 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF550Q7Z398 422 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OCC1Q8TAD7 63 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL16Q9H2A7 254 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PRO0628Q9UI54 55 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0G2JMZ2 1700 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF737O75373 536 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CXorf1O96002 111 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS2P05162 132 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 COX7A2P14406 83 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 COL8A1P27658 744 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TIRAPP58753 221 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GAGE2BQ13066 116 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MYBPHQ13203 477 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GAGE2EQ4V326 116 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PIP4P1Q86T03 277 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR2L13Q8N349 312 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NHSQ6T4R5 1651 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 A0A087X0K7 114 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf226A1L170 272 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NBR2O15453 112 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TBL1XO60907 577 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR9G9P0C7N8 305 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CPMP14384 443 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 WASP42768 502 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 WFDC2Q14508 124 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KCNK15Q9H427 330 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PS18 150 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TNFSF11O14788 317 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MALP21145 153 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NTF4P34130 210 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 STPG1Q5TH74 334 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 BAALCQ8WXS3 180 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.24□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
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