RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TMEM215Q68D42 235 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LCN8Q6JVE9 175 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LYG2Q86SG7 212 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 WDR86Q86TI4 376 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 L3HYPDHQ96EM0 354 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TRIB3Q96RU7 358 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MS4A8Q9BY19 250 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SCN2AQ99250 2005 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZFYVE9O95405 1425 aa3.08□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TMEM131Q92545 1883 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF98A6NK75 572 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CST8O60676 142 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NRASP01111 189 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 HRASP01112 189 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KRASP01116 189 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 IFNA21P01568 189 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 REG1AP05451 166 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CRHP06850 196 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 REG1BP48304 166 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FABP5Q01469 135 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 EDDM3AQ14507 147 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DEFB115Q30KQ5 88 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LINC00303Q3SY05 128 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MESTQ5EB52 335 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 S100A7AQ86SG5 101 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MARCH3Q86UD3 253 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR6V1Q8N148 313 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 Q8WTZ3 238 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 REEP6Q96HR9 211 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FOPNLQ96NB1 174 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NID2Q14112 1375 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CNTLNQ9NXG0 1405 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 UGGT1Q9NYU2 1555 aa3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GV50 99 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 STK16O75716 305 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CCNKO75909 580 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PCNTO95613 3336 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PPBPP02775 128 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SCGB1A1P11684 91 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF708P17019 499 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 GABRA3P34903 492 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TMEM33P57088 247 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 RAB5BP61020 215 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 EBI3Q14213 229 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 LIN52Q52LA3 116 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 DHFR2Q86XF0 187 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 NALCNQ8IZF0 1738 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 STARD4Q96DR4 205 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ACY3Q96HD9 319 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR2V2Q96R30 315 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 MED28Q9H204 178 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.06□□□□□ -1.92
CCL20-204ENST00000489160 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms