RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 UTF1Q5T230 341 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HACD4Q5VWC8 232 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF561Q8N587 486 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SPICQ8N5J4 248 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 OR8B2Q96RD0 313 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 SRRQ9GZT4 340 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 MMP26Q9NRE1 261 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 MIOXQ9UGB7 285 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 ODAMA1E959 279 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 ORC5O43913 435 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MMP23AO75900 390 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SCGNO76038 276 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PMP2P02689 132 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SCTP09683 121 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 GSTT2BP0CG30 244 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 SSTR5P35346 364 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 KCNJ8Q15842 424 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FAM189A2Q15884 450 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SHEQ5VZ18 495 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 Q8N402 240 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR5R1Q8NH85 324 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR1L1Q8NH94 360 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GPX8Q8TED1 209 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 Q9N2K0 584 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 VPS13CQ709C8 3753 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CR1P17927 2039 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A0A096LNT2 108 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0A6YYH2 397 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PPE3 182 aa3.81□□□□□ -1.8
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