RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 BLNKQ8WV28 456 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CDC14BO60729 498 aa6.57□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CHRNA7P36544 502 aa6.57□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.57□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.57□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.57□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.56□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 GLIPR1P48060 266 aa6.56□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LRRC29Q8WV35 223 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CCL19Q99731 98 aa6.55□□□□□ -1.36
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