RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	AKR1D1	P51857	326 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	EFNA3	P52797	238 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CDKN2D	P55273	166 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RND3	P61587	244 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TBPL1	P62380	186 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PSG4	Q00888	419 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RELA	Q04206	551 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PAX8	Q06710	450 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	GRK1	Q15835	563 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	WDR59	Q6PJI9	974 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OPN5	Q6U736	354 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	NPW	Q8N729	165 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PPCDC	Q96CD2	204 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	IP6K3	Q96PC2	410 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	GINS3	Q9BRX5	216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CHST5	Q9GZS9	411 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	EHF	Q9NZC4	300 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	GNG8	Q9UK08	70 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	NF1	P21359	2839 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105		F6UB75	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SEMG1	P04279	462 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	HPN	P05981	417 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	IL3	P08700	152 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TSPAN19	P0C672	248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PIRT	P0C851	137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	KLK2	P20151	261 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PSMB9	P28065	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CA7	P43166	264 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	MAP2K4	P45985	399 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SERPINB10	P48595	397 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SPINT3	P49223	89 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RBP2	P50120	134 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TDGF1P3	P51864	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	UBE2E1	P51965	193 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	LIM2	P55344	173 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	BID	P55957	195 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TAS2R43	P59537	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RHOB	P62745	196 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	NSDHL	Q15738	373 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RNF212	Q495C1	297 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR10K2	Q6IF99	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PNKD	Q8N490	385 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PIFO	Q8TCI5	191 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PYURF	Q96I23	114 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RARRES2	Q99969	163 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PUM2-208	ENST00000432105	DNHD1	Q96M86	4753 aa		3.76	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms