RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 FOLR1P15328 257 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 DTYMKP23919 212 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 OPRM1P35372 400 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 MFAP4P55083 255 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFA6P56556 154 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 PIGPP57054 158 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 OR1D5P58170 312 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 LSM6P62312 80 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 GRB2P62993 217 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 FOXF1Q12946 379 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ARL6IP1Q15041 203 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 HAGHQ16775 308 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SP6Q3SY56 376 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 HIKESHIQ53FT3 197 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 PYY3Q5JQD4 70 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 C9orf152Q5JTZ5 239 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 PHYHD1Q5SRE7 291 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 DNLZQ5SXM8 178 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NCMAPQ5T1S8 102 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf189Q5VU69 101 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 CARD17Q5XLA6 110 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TEX38Q6PEX7 206 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SPNS3Q6ZMD2 512 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS58Q8IYP2 241 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 THAP8Q8NA92 274 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 LFNGQ8NES3 379 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 OR4D5Q8NGN0 318 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 CD300LFQ8TDQ1 290 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 LMX1AQ8TE12 382 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 HAS2Q92819 552 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM54Q969K7 222 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SGK3Q96BR1 496 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NTNG2Q96CW9 530 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 RAB39BQ96DA2 213 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 MS4A10Q96PG2 267 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 S100A13Q99584 98 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SUCNR1Q9BXA5 334 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ANGPTL4Q9BY76 406 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 CHST5Q9GZS9 411 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NAA60Q9H7X0 242 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF160Q9HCG1 818 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 KCNJ16Q9NPI9 418 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SDHAF3Q9NRP4 125 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 DOK5Q9P104 306 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 AK3Q9UIJ7 227 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ANXA10Q9UJ72 324 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO7Q9Y3I1 522 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TMED3Q9Y3Q3 217 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 IGSF23A1L1A6 192 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NKX2-6A6NCS4 301 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF726A6NNF4 738 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF724A8MTY0 619 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF732B4DXR9 585 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TRDCB7Z8K6 153 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 H3BQ15 152 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SEC16AO15027 2179 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ST8SIA3O43173 380 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 DHRS3O75911 302 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 PRH1P02810 166 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 HEXBP07686 556 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 SERPINA2P20848 420 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 GABRR1P24046 479 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ATP6V0CP27449 155 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 ASCL1P50553 236 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 CLDN17P56750 224 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 OR2B8PP59922 312 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 RAB2AP61019 212 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 UBE2KP61086 200 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 RND3P61587 244 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRK-202ENST00000368205 H3F3AP84243 136 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms