RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PPOXP50336 477 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZT83 130 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM140Q9NV12 185 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV3-19P01714 112 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 UCP3P55916 312 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS11Q6UWP2 260 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OR4C12Q96R67 309 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CBY3A6NI87 242 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MARCH11A6NNE9 402 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDL1O75783 438 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB4O95168 129 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CD74P04233 296 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PRNTQ86SH4 94 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 LNP1A1A4G5 178 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf51A8MQB3 221 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF273Q14593 569 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 NCOR1O75376 2440 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD5Q96QE3 1844 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 HKR1P10072 659 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 NPBWR2P48146 333 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 FAM209AQ5JX71 171 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 LHFPL5Q8TAF8 219 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A17O43808 307 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MT-ND6P03923 174 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MGPP08493 103 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF137PP52743 207 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OR9G1Q8NH87 305 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF9Q07011 255 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RECKO95980 971 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 THY1P04216 161 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RND2P52198 227 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A53Q5H9E4 307 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM78Q5T7P6 136 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 STPG3Q8N7X2 389 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CBY1Q9Y3M2 126 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ACACAQ13085 2346 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087X0M5 115 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GX30 115 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM45BQ96B21 275 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OR2A4O95047 310 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35E4Q6ICL7 350 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OR2A7Q96R45 310 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PS18 150 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PPIAL4GP0DN37 164 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PF4V1P10720 104 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 FDCSPQ8NFU4 85 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MYOZ3Q8TDC0 251 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 VWCEQ96DN2 955 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 GLIPR1P48060 266 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF343Q6P1L6 599 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MIOXQ9UGB7 285 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 F12P00748 615 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 NAT2P11245 290 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 COX6B1P14854 86 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35B1P78383 322 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MIC13Q5XKP0 118 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 DNM1P46Q6ZS02 220 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MYO16Q9Y6X6 1858 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 H2BFSP57053 126 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PRR19A6NJB7 356 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RFPL3SP0C7P2 107 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OR4C13Q8NGP0 309 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM186Q96B77 213 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 GPHA2Q96T91 129 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA7Q8IZY2 2146 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 KBTBD11O94819 623 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 IL36RNQ9UBH0 155 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 GLRXP35754 106 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CD81P60033 236 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD12Q8N2K0 398 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 GUCA2BQ16661 112 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 METTL26Q96S19 204 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TCF19Q9Y242 345 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RAMP1O60894 148 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 TEX29Q8N6K0 151 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OR5P3Q8WZ94 311 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PGPA6NDG6 321 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-203ENST00000366687 LTBRP36941 435 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-203ENST00000366687 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF16Q9NXF7 216 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-203ENST00000366687 CSRP2Q16527 193 aa17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms