RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365359.1

RNU6-1138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1138P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MED12Q93074 2177 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MEIS3P1A6NDR6 274 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SC5DO75845 299 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PSMG1O95456 288 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ANXA8P13928 327 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CA5AP35218 305 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ACTR1BP42025 376 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CLDN8P56748 225 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DAOAP59103 153 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GNA12Q03113 381 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SCGB1D4Q6XE38 83 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C1orf158Q8N1D5 194 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GPATCH11Q8N954 259 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C12orf29Q8N999 325 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR4A15Q8NGL6 344 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR4C6Q8NH72 309 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PATE1Q8WXA2 126 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR5P2Q8WZ92 322 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LINC00526Q96FQ7 95 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SFRP2Q96HF1 295 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HBEGFQ99075 208 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DMAC2Q9NW81 257 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 VAPAQ9P0L0 249 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LHFPL6Q9Y693 200 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 REREQ9P2R6 1566 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TRAV7A0A075B6U4 112 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MGAT4DA6NG13 374 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR51F1A6NGY5 319 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CDIPTO14735 213 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NCR3O14931 201 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBDO15205 165 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MPZL2O60487 215 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 VAPBO95292 243 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGLV3-27P01718 113 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RANBP1P43487 201 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GABRA2P47869 451 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AQP5P55064 265 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATP5J2P56134 94 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C1QTNF8P60827 252 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DSTNP60981 165 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TSPAN5P62079 268 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAHD1Q6P587 224 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 Q6ZT83 130 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR8B3Q8NGG8 313 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR6N2Q8NGY6 317 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF675Q8TD23 568 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TESCQ96BS2 214 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IFT46Q9NQC8 304 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM216Q9P0N5 145 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IFNKQ9P0W0 207 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LINC00527Q9UJ94 153 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SMARCA4P51532 1647 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 E9PCH4 1651 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRASO14807 208 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NDUFB2O95178 105 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TFPTP0C1Z6 253 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CD79BP40259 229 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EFNA4P52798 201 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RAB14P61106 215 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MIAQ16674 131 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM27BQ5VT28 67 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 XKRXQ6PP77 449 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SPINK6Q6UWN8 80 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C1orf174Q8IYL3 243 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C17orf78Q8N4C9 275 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR13C8Q8NGS7 320 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CIB1Q99828 191 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR51B6Q9H340 312 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBQLN4Q9NRR5 601 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CISHQ9NSE2 258 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NAT8Q9UHE5 227 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PTPRSQ13332 1948 aa-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms