RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RNF5Q99942 180 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PAXXQ9BUH6 204 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HCFC1P51610 2035 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf49A4QMS7 147 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR4C46A6NHA9 309 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MGST3O14880 152 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALT3O60512 393 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NEURL1O76050 574 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF385BQ569K4 471 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM186Q96B77 213 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TM4SF19Q96DZ7 209 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FITM1A5D6W6 292 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DPRXA6NFQ7 191 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V0CP27449 155 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ERVK11-1P61568 191 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MGAT2Q10469 447 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 K7N7A8 449 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MPZL1O95297 269 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DNAL4O96015 105 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 BGLAPP02818 100 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 THY1P04216 161 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf88P0DMB2 117 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CCL1P22362 96 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GPR183P32249 361 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MEOX1P50221 254 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MESTQ5EB52 335 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DL4Q99706 377 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FCER1GP30273 86 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RIPPLY3P57055 190 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MARCH3Q86UD3 253 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 EML2O95834 649 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5G1P05496 136 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 UCP1P25874 307 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PLNP26678 52 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5G3P48201 142 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5G2Q06055 141 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IER5LQ5T953 404 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ASCL2Q99929 193 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PRE2 83 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SIVA1O15304 175 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR4C3Q8NH37 302 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C5AR2Q9P296 337 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SIGMAR1Q99720 223 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TNFSF13O75888 250 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GUCA2AQ02747 115 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TFF2Q03403 129 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR9G1Q8NH87 305 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS1P07477 247 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FCGR3AP08637 254 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SELENOPP49908 381 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 BTLAQ7Z6A9 289 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR2Z1Q8NG97 314 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms