RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 IL22RA2Q969J5 263 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SPSB4Q96A44 273 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR5B12Q96R08 314 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 H7BYZ3 331 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CYC1P08574 325 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 BAXQ07812 192 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD39Q53RE8 183 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 HINT2Q9BX68 163 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PITPNC1Q9UKF7 332 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SOX8P57073 446 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ID3Q02535 119 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 H0Y980 276 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 UCP2P55851 309 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF766Q5HY98 468 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 FBXW9Q5XUX1 488 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR1P1Q8NH06 330 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RAB24Q969Q5 203 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 GUCD1Q96NT3 240 aa16.79■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 GNB2P62879 340 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PAX5Q02548 391 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 FAM90A2PQ658T7 463 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 C11orf42Q8N5U0 333 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 WDYHV1Q96HA8 205 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR4C12Q96R67 309 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DIRC2Q96SL1 478 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ASCL3Q9NQ33 180 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PTTG1IPP53801 180 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PAX9P55771 341 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R30P59541 319 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF506Q5JVG8 444 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 COLCA1Q6ZS62 124 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SH2D1BO14796 132 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 FGFRL1Q8N441 504 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR4F5Q8NH21 305 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR4F4Q96R69 305 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM204Q9BSN7 226 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 MED13LQ71F56 2210 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 NKX2-8O15522 239 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 BCL2P10415 239 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 GALR1P47211 349 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 UBE2G2P60604 165 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DRAM1Q8N682 238 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 J3QT63 122 aa16.77■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 ERASQ7Z444 233 aa16.77■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 OR5D13Q8NGL4 314 aa16.77■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 SSTR5P35346 364 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 TGFBR3Q03167 851 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 IL24Q13007 206 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 Q6ZSR3 168 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 PSG11Q9UQ72 335 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 MPC1Q9Y5U8 109 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 PSPNO60542 156 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 HBE1P02100 147 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 GZMHP20718 246 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 ACP1P24666 158 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 MPV17P39210 176 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 HBG1P69891 147 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 HBG2P69892 147 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 SLC38A11Q08AI6 406 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 SPRR3Q9UBC9 169 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1B0GU03 582 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 OR5B21A6NL26 309 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 IGKV1-39P01597 117 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 IGKV1-5P01602 117 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 IGKV1D-39P04432 117 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 EDDM3BP56851 147 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 Q5PR19 223 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 WDR86Q86TI4 376 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM45BQ96B21 275 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 CRYAAP02489 173 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 TEX38Q6PEX7 206 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF737O75373 536 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 LMO1P25800 156 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 HAND1O96004 215 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS2-201ENST00000329078 GNG12Q9UBI6 72 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms