RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 ZG16O60844 167 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 S1PR2O95136 353 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 FHITP49789 147 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 ECSCRQ19T08 205 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 Q6ZT83 130 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF596Q8TC21 504 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 PATJQ8NI35 1801 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 UCP3P55916 312 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 KCNMB1Q16558 191 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 MIC13Q5XKP0 118 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 HCP5Q6MZN7 132 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 FADS6Q8N9I5 356 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 SNURFLB1AK76 121 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 WNT9BO14905 357 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 NDUFB4O95168 129 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 MELTFP08582 738 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 COX19Q49B96 90 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 SSTR5P35346 364 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 DRAM1Q8N682 238 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM140Q9NV12 185 aa8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
TMOD3-201ENST00000308580 IGSF23A1L1A6 192 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CD8AP01732 235 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF883P0CG24 379 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 PTGDSP41222 190 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 TNFRSF9Q07011 255 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 H0YL77 283 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 NPIPB7O75200 414 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 PLAUP00749 431 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CFHR1Q03591 330 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 PAXXQ9BUH6 204 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CACNA1HO95180 2353 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 MSGN1A6NI15 193 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 MPDU1O75352 247 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 VWA1Q6PCB0 445 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00869P0C866 280 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 HYPMO75409 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RHBDL1O75783 438 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 MC5RP33032 325 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ERVFRD-1P60508 538 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RNF151Q2KHN1 245 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 J3KRW8 73 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 TCAPO15273 167 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ORM1P02763 201 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 FAM87AP0C7U9 286 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RAB24Q969Q5 203 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 J3QW42 95 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 M0R2Z0 102 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A17O43808 307 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 MST1P26927 711 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CCKARP32238 428 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 TM2D1Q9BX74 207 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RND3P61587 244 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 SLC35B1P78383 322 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RARRES2Q99969 163 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 JPT1Q9UK76 154 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 G0S2P27469 103 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 STARD4Q96DR4 205 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 TCF19Q9Y242 345 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 SMIM6P0DI80 62 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 DPF1Q92782 380 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 CECR9P0C854 216 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 RND2P52198 227 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 GAS1P54826 345 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-201ENST00000308580 LRP11Q86VZ4 500 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms