RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HYPMO75409 117 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CTDSPLO15194 276 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PRF1P14222 555 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 EPDR1Q9UM22 224 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 H0Y980 276 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PRRG2O14669 202 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SPRY3O43610 288 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV3-15P01624 115 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SNAI2O43623 268 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PMVKQ15126 192 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ST8SIA1Q92185 356 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SARGQ9BW04 601 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SCAND1P57086 179 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IFITM3Q01628 133 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4A5Q8NH83 315 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 C17orf51A8MQB3 221 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ISG15P05161 165 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF585BQ52M93 769 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 V9GYH0 126 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GTL3 188 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF688P0C7X2 276 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TEPPQ6URK8 271 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF114Q8NC26 417 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ACANP16112 2415 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 F2RL2O00254 374 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC01553A4QN01 128 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00614P0C842 121 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ECSCRQ19T08 205 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC25A1P53007 311 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM50BP56557 158 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNMB1Q16558 191 aa9.79□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NGFP01138 241 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OTOSQ8NHW6 89 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 KLKB1P03952 638 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CDAP32320 146 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD1Q96SE0 405 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OR13H1Q8NG92 308 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CA10Q9NS85 328 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PRD5 423 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PRF3 423 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PRM7 423 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 APELAP0DMC3 54 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NUBP1P53384 320 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 METTL12A8MUP2 240 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PRNDQ9UKY0 176 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 MGAMO43451 1857 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HPRT1P00492 218 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 C17orf99Q6UX52 265 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IL2RAP01589 272 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NPPBP16860 134 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PLPP2O43688 288 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 S1PR2O95136 353 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4C3Q8NH37 302 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXC13P31276 330 aa9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.77□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.77□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PTP4A3O75365 173 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 CX3CL1P78423 397 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 ASB10Q8WXI3 467 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 SRD5A2P31213 254 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 CBLN1P23435 193 aa9.77□□□□□ -0.85
HDGFL3-201ENST00000299633 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms