RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV2-14P01704 120 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 IL3RAP26951 378 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 HTR1DP28221 377 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 GPR12P47775 334 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 RIPPLY3P57055 190 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 DHODHQ02127 395 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 BAMBIQ13145 260 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 FCN2Q15485 313 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MXRA5Q9NR99 2828 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 LY6LH3BQJ8 138 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SLC22A5O76082 557 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 GNRHRP30968 328 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R1AQ13522 171 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MSMO1Q15800 293 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf30Q96GV9 206 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 JMJD8Q96S16 334 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 DPM3Q9P2X0 92 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf170A2RU37 121 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 LEUTXA8MZ59 168 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PROP1O75360 226 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 VAMP1P23763 118 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 CD83Q01151 205 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 DRAM1Q8N682 238 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 AJUBAQ96IF1 538 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PHB2Q99623 299 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 HSD17B6O14756 317 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 CEACAM3P40198 252 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 OR11H7Q8NGC8 314 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 C17orf50Q8WW18 174 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 S1PR3Q99500 378 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ANXA3P12429 323 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PI3P19957 117 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 HILS1P60008 231 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 CD300CQ08708 224 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 TCTE3Q8IZS6 198 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 BVESQ8NE79 360 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM230Q96A57 120 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MALSU1Q96EH3 234 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 GPR31O00270 319 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SFT2D2O95562 160 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 S100GP29377 79 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 PIGPP57054 158 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 SSX2Q16385 188 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 Q6YL49 198 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 MITD1Q8WV92 249 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 RPEQ96AT9 228 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0B4J2A0 478 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 OOSP1A8MZH6 123 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 COQ8AQ8NI60 647 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 BTBD17A6NE02 478 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 M0R1X1 148 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXD11-201ENST00000249504 TXNL1O43396 289 aa15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms