RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CFP	P27918	469 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB31	Q13636	194 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR87	Q9BY21	358 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC00587	B1AMM8	73 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM50A	O95807	157 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PSG7	Q13046	419 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449		Q6ZRM9	215 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	IGF2R	P11717	2491 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1B0GU03	582 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	BCL2	P10415	239 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	GALR1	P47211	349 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35B1	P78383	322 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	HTD2	P86397	168 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RHOV	Q96L33	236 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TSTD3	H0UI37	97 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	KLK10	O43240	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	UCP1	P25874	307 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	THBS3	P49746	956 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	C12orf77	C9JDV5	145 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CA11	O75493	328 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CD5	P06127	495 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CCL8	P80075	99 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	GFRA1	P56159	465 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TCL1A	P56279	114 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PRR27	Q6MZM9	219 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449		Q8IYB0	196 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CLN5	O75503	358 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	UCP3	P55916	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TFF3	Q07654	80 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PLGLA	Q15195	96 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ACSM6	Q6P461	480 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449		Q8WTZ3	238 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	XKRY2	A2RUG3	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	C21orf140	B9A014	251 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449		K7N7A8	449 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	SELL	P14151	372 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF90	Q03938	601 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CCL17	Q92583	94 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PSPN	O60542	156 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	CLDN14	O95500	239 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	BAGE3	Q86Y29	109 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	BAGE2	Q86Y30	109 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSS3-208	ENST00000616449	ODAM	A1E959	279 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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