RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IL19	Q9UHD0	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LTBP2	Q14767	1821 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790		A0A0J9YW62	118 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790		G3V3Y1	287 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LAMTOR5	O43504	91 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RAMP1	O60894	148 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HPRT1	P00492	218 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CD1B	P29016	333 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR3A1	P47881	315 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	KRTDAP	P60985	99 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM42	Q69YG0	159 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	STUM	Q69YW2	141 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LRP11	Q86VZ4	500 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LYPD6	Q86Y78	171 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF525	Q8N782	197 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	VWCE	Q96DN2	955 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR4C12	Q96R67	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR2D2	Q9H210	308 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	RBKS	Q9H477	322 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	GP6	Q9HCN6	339 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1B0GV90	55 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	LILRA1	O75019	489 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SCT	P09683	121 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	CRYGS	P22914	178 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	FOXC1	Q12948	553 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR1C1	Q15619	314 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	R3HDM4	Q96D70	268 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMP1-216	ENST00000592790	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	HAND1	O96004	215 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	GRP	P07492	148 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CTSB	P07858	339 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CCL3	P10147	92 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	G0S2	P27469	103 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	AMT	P48728	403 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SOX8	P57073	446 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	UBE2G2	P60604	165 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	FOXL1	Q12952	345 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	NMS	Q5H8A3	153 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PYY3	Q5JQD4	70 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TEPP	Q6URK8	271 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		Q6ZSR3	168 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	OR5B3	Q8NH48	314 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	OR51B6	Q9H340	312 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	HIVEP2	P31629	2446 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		A0A096LPE4	126 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PPZ6	126 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	HELT	A6NFD8	242 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		B4E171	279 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		J3KRW8	73 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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