RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 SOX14O95416 240 aa4.6□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 GYPEP15421 78 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 CXCL12P48061 93 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 INPP1P49441 399 aa4.6□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 LEG1Q6P5S2 330 aa4.6□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 Q9UF83 564 aa4.6□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 OR12D2P58182 307 aa4.59□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.59□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.59□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 DERL1Q9BUN8 251 aa4.59□□□□□ -1.67
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CAPN3-211ENST00000562199 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 VDAC3Q9Y277 283 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 ASF1AQ9Y294 204 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPN3-211ENST00000562199 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.59□□□□□ -1.67
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