RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAM25AB3EWG3 89 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAM25CB3EWG5 89 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAM25GB3EWG6 89 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 H0YJW9 148 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SULT1C2O00338 296 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 TUSC2O75896 110 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR8U9P0C7N5 309 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NAT1P18440 290 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MC5RP33032 325 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 HNF4GQ14541 408 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 Q6ZS46 218 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR8U1Q8NH10 309 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RNF150Q9ULK6 438 aa14.62□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 HAX1O00165 279 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RBBP9O75884 186 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 Q8N9W7 124 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 GPX8Q8TED1 209 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 M0R1X1 148 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SLC22A5O76082 557 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 KRTAP10-3P60369 221 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RNF5Q99942 180 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NDUFA3O95167 84 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 APOA2P02652 100 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR5H8P0DN80 308 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 TAS2R46P59540 309 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ACTBP60709 375 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CDK10Q15131 360 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MMDQ15546 238 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MSMO1Q15800 293 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PDPNQ86YL7 162 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF383Q8NA42 475 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NPBQ8NG41 125 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 C5orf30Q96GV9 206 aa14.59□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC160A6NGH7 325 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 RGS5O15539 181 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 IGHG2P01859 326 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 RCVRNP35243 200 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 THBS3P49746 956 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 F2RL1P55085 397 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 LAX1Q8IWV1 398 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 CTDSP2O14595 271 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 NBR2O15453 112 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 PEX14O75381 377 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.57□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 H7C2Y5 167 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 KCNAB3O43448 404 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 SPDEFO95238 335 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 PPYP01298 95 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 FCGR2CP31995 323 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 DYRK1AQ13627 763 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS7A-216ENST00000543170 DDB2Q92466 427 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms