RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 ADRA2CP18825 462 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 HNF4GQ14541 408 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 NUDT19A8MXV4 375 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 M0QYG6 137 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PLPP2O43688 288 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR4E1P0C645 316 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CAMLGP49069 296 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SLC35G3Q8N808 338 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OOEPA6NGQ2 149 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 ZNF727A8MUV8 499 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 TRGC2P03986 189 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SFTPBP07988 381 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 COL10A1Q03692 680 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 MRI1Q9BV20 369 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 HAND1O96004 215 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CAV2P51636 162 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SLC6A7Q99884 636 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 A0A1B0GTI1 187 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CD99P14209 185 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CDK2P24941 298 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DLX1P56177 255 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 TOMM40LQ969M1 308 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 SMR3AQ99954 134 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 RNF150Q9ULK6 438 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 TFPI2P48307 235 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 HMGN3Q15651 99 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 RNF144BQ7Z419 303 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DVL1O14640 695 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CA11O75493 328 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DANCRP0C864 163 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 AKAIN1P0CW23 69 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 GNB3P16520 340 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 AMY2BP19961 511 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 TMEM104Q8NE00 496 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 TENM4Q6N022 2769 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 A0A1W2PPQ1 181 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 H7C417 338 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CIDEAO60543 219 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CD8AP01732 235 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 EFNB1P98172 346 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 GUCA2AQ02747 115 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PLGLAQ15195 96 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 RNLSQ5VYX0 342 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 A8MWP6 167 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OGG1O15527 345 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CD3DP04234 171 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CHATP28329 748 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 GPR157Q5UAW9 335 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 LEAP2Q969E1 77 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms