RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	CYYR1	Q96J86	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CLCC1	Q96S66	551 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MGLL	Q99685	303 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FBXL15	Q9H469	300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	DUSP21	Q9H596	190 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		V9GY05	133 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		A0A075B6Q4	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		A0A1W2PN81	502 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR5H14	A6NHG9	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SLC17A2	O00624	439 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RRH	O14718	337 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CNIH1	O95406	144 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NAPSA	O96009	420 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HLA-DRB1	P01911	266 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SCT	P09683	121 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CHRNA7	P36544	502 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TALDO1	P37837	337 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HSPA13	P48723	471 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RAB9A	P51151	201 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HLA-DRB3	P79483	266 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RNF152	Q8N8N0	203 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NPB	Q8NG41	125 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NRG4	Q8WWG1	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CNBD2	Q96M20	576 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PECR	Q9BY49	303 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	KLK15	Q9H2R5	256 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		Q9N2K0	584 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RAB22A	Q9UL26	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HSF4	Q9ULV5	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		A0A0A6YYD4	124 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TRDC	B7Z8K6	153 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ITGB1BP1	O14713	200 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	BET1	O15155	118 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RBBP9	O75884	186 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	APOA2	P02652	100 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR8U8	P0C7N1	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CT45A6	P0DMU7	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CT45A5	P0DMU8	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CT45A7	P0DMV0	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CD37	P11049	281 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CRHBP	P24387	322 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	GADD45A	P24522	165 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MYL9	P24844	172 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PSMB8	P28062	276 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ARPC4	P59998	168 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CX3CL1	P78423	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	QRFP	P83859	136 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FABP5	Q01469	135 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CFHR3	Q02985	330 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF616	Q08AN1	781 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CBX3	Q13185	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ARFRP1	Q13795	201 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RAB3C	Q96E17	227 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MS4A10	Q96PG2	267 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PRR25	Q96S07	402 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RNF5	Q99942	180 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	GNB4	Q9HAV0	340 aa		6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		H0YJW9	148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		J3QL48	77 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		M0R1X1	148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FCN1	O00602	326 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OVOL1	O14753	267 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TFAP2A	P05549	437 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SERPINB10	P48595	397 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	INSL3	P51460	131 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM50B	P56557	158 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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