RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	DHRS3	O75911	302 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	C1QL1	O75973	258 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	CDRT1	O95170	752 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	LYPD3	O95274	346 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	IGF1	P05019	195 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ORM2	P19652	201 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	AGTR1	P30556	359 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	EMP1	P54849	157 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	XG	P55808	180 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC35A2	P78381	396 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MYBPH	Q13203	477 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R1A	Q13522	171 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF144B	Q7Z419	303 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OSR2	Q8N2R0	312 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2T4	Q8NH00	348 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4C3	Q8NH37	302 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR146	Q96CH1	333 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	RETN	Q9HD89	108 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	FZR1	Q9UM11	496 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0G2JLM5	398 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971		E9PLN8	166 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BS24	57 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971		M0R233	179 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MYL12B	O14950	172 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP5L	O75964	103 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFAND5	O76080	213 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	HBE1	P02100	147 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	CELA2A	P08217	269 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	LHX2	P50458	406 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	IFITM3	Q01628	133 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	FMOD	Q06828	376 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	GUSBP1	Q15486	140 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF74	Q16587	644 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	C12orf73	Q69YU5	71 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	LCN10	Q6JVE6	187 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZSR3	168 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SPIC	Q8N5J4	248 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	PRSS33	Q8NF86	280 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	CHIA	Q9BZP6	476 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52D1	Q9H346	318 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	DUSP21	Q9H596	190 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		5.7	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	SEC16A	O15027	2179 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GWA3	101 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5B21	A6NL26	309 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	COLCA2	A8K830	154 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MFNG	O00587	321 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MPPED1	O15442	326 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	REM1	O75628	298 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	MOS	P00540	346 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FBXO38-208	ENST00000504971	GYPE	P15421	78 aa		5.69	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms