RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 JTBO76095 146 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV3-15P01624 115 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PET100P0DJ07 73 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF20P17024 532 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PAX2Q02962 417 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PP6455Q8WZ26 134 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMARCE1-211ENST00000493660 LYZL4Q96KX0 146 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SPXQ9BT56 116 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMARCE1-211ENST00000493660 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FUT9Q9Y231 359 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.15□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 V9GY05 133 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMARCE1-211ENST00000493660 IFITM5A6NNB3 132 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 HSD17B6O14756 317 aa6.15□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 MMDQ15546 238 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.15□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 NIT1Q86X76 327 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.15□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FGGYQ96C11 551 aa6.15□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CLN8Q9UBY8 286 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.15□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf49A4QMS7 147 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR7C2O60412 319 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF429Q86V71 674 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SPSB1Q96BD6 273 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MS4A10Q96PG2 267 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 GFI1Q99684 422 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CHODLQ9H9P2 273 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 MGAQ8IWI9 3026 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 G3V4G9 280 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMARCE1-211ENST00000493660 RHBDL1O75783 438 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10J4P0C629 311 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 STAG3L2P0CL84 134 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ADRA2CP18825 462 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FUT3P21217 361 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ASCL1P50553 236 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 BATF2Q8N1L9 274 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 YPEL2Q96QA6 119 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.14□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf63A6NC05 138 aa6.13□□□□□ -1.43
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