RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 FRYQ5TBA9 3013 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 C17orf98A8MV24 154 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 TSPAN4O14817 238 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 C1QL1O75973 258 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 IFNA5P01569 189 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 FHITP49789 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 HBG1P69891 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 HBG2P69892 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 EDDM3AQ14507 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 STUMQ69YW2 141 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 RFESDQ8TAC1 157 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 PLCE1Q9P212 2302 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 LRRC30A6NM36 301 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 C9JQL5 133 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 AGPAT2O15120 278 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 AARDQ4LEZ3 155 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 PSG11Q9UQ72 335 aa14.52□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 FAM74A7A6NL05 159 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ST8SIA5O15466 376 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 S1PR2O95136 353 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 LY86O95711 162 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ZNF525Q8N782 197 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 DYSFO75923 2080 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 DPRXA6NFQ7 191 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 LINC00473A8K010 186 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 PROP1O75360 226 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 KRASP01116 189 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 THBDP07204 575 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 IAPPP10997 89 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 G6PCP35575 357 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 GPR12P47775 334 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 RBKSQ9H477 322 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 CALYQ9NYX4 217 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 GNG12Q9UBI6 72 aa14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 AKAP13Q12802 2813 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 H3BP45 60 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 HBE1P02100 147 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 TNFRSF1AP19438 455 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 RAB7AP51149 207 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 TLE4Q04727 773 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 RBPJQ06330 500 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ATP6V1FQ16864 119 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 Q3ZCU0 254 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 CORO2AQ92828 525 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 KIAA1456Q9P272 454 aa14.5□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 HPRT1P00492 218 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 KIR2DS2P43631 304 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 SERF2P84101 59 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ARL16Q0P5N6 197 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ADIPOQQ15848 244 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 GAFA1Q96PS6 74 aa14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO2-204ENST00000464025 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms