RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 IGHV1-46P01743 117 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FGF7P21781 194 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TMEM50BP56557 158 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 MKXQ8IYA7 352 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 OR2V2Q96R30 315 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 WFDC1Q9HC57 220 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 HSD17B6O14756 317 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 GGNBP1Q5YKI7 109 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 OSR2Q8N2R0 312 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 NDUFAF3Q9BU61 184 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TM2D1Q9BX74 207 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SMCO3A2RU48 225 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 A8MWP6 167 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TRAPPC2LH3BP13 241 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 CD200P41217 278 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 NHLH2Q02577 135 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PDCD1Q15116 288 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TAF9Q16594 264 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SLC35E3Q7Z769 313 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 Q8NFD4 153 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FAM222BQ8WU58 562 aa20.49■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 GABRR1P24046 479 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ITLN1Q8WWA0 313 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TVP23CQ96ET8 276 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PRO1933Q9H354 126 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 EHFQ9NZC4 300 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ST3GAL6Q9Y274 331 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TENM4Q6N022 2769 aa20.48■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 CA11O75493 328 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SRP19P09132 144 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 RAB4AP20338 218 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FHITP49789 147 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 HNF4GQ14541 408 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 IL13RA2Q14627 380 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1456Q9P272 454 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ZNF727A8MUV8 499 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FABP4P15090 132 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 IL2RGP31785 369 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 WDR82Q6UXN9 313 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SLC25A31Q9H0C2 315 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 VSTM5A8MXK1 200 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TRGC2P03986 189 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 RBM11P57052 281 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ERVFRD-1P60508 538 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 DLK1P80370 383 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ARFRP1Q13795 201 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ARL6IP1Q15041 203 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 DECR2Q9NUI1 292 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TMEM242Q9NWH2 141 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PITPNC1Q9UKF7 332 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TRGC1P0CF51 173 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PGA5P0DJD9 388 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FGF12P61328 243 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 GFI1BQ5VTD9 330 aa20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 C17orf100A8MU93 164 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 WNT9BO14905 357 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 CYB5BO43169 146 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 MBPP02686 304 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 DUSP1P28562 367 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ERVK11-1P61568 191 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 EFNB3Q15768 340 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 MUC15Q8N387 334 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 FAM213BQ8TBF2 198 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 RARRES2Q99969 163 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 HIPK2Q9H2X6 1198 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 CCL8P80075 99 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ZNF429Q86V71 674 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 MOGAT3Q86VF5 341 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2BLQ99880 126 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 DYSFO75923 2080 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 KNG1P01042 644 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ZNF343Q6P1L6 599 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms