RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROP1O75360 226 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CATR1Q13166 79 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TATDN3Q17R31 274 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D26Q86UD7 250 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALNT14Q96FL9 552 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5orf30Q96GV9 206 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEX2Q9BXY8 128 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEX1Q9HBH7 125 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPM3Q9P2X0 92 aa13.76□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LY6LH3BQJ8 138 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R1X1 148 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA3P12429 323 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 F2RP25116 425 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R1AQ13522 171 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR157Q5UAW9 335 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDZD9Q8IXQ8 264 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX29Q8N6K0 151 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C18orf12Q96KH6 178 aa13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf170A2RU37 121 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf66A4D0T2 115 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNRPGP15A8MWD9 76 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OOSP1A8MZH6 123 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD5LO43866 347 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNA2P01563 188 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1-69P01742 117 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPHA1P21709 976 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 VAMP1P23763 118 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 THBS3P49746 956 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPIFB3P59826 476 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS2Q13268 280 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYG2Q86SG7 212 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPEQ96AT9 228 aa13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV40A0A0B4J280 105 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0B4J293 547 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0Y980 276 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPFFO15130 113 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFT2D2O95562 160 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 AVPP01185 164 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51H1Q8NH63 302 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MALSU1Q96EH3 234 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.73□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0A6YYJ9 748 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CT45A6P0DMU7 189 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CT45A5P0DMU8 189 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CT45A7P0DMV0 189 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAA4P35542 130 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DS2P43631 304 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPHA2Q96T91 129 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC22CQ9BRL7 303 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALG5Q9Y673 324 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITPR2Q14571 2701 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PRD5 423 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PRF3 423 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PRM7 423 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00473A8K010 186 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5AC1P0C628 307 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRPXP78539 464 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBX3Q13185 183 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8H3Q8N146 312 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52B4Q8NGK2 314 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 COQ8AQ8NI60 647 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NANPQ8TBE9 248 aa13.71□□□□□ -0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MITD1Q8WV92 249 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms