RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LINC00869P0C866 280 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 APELAP0DMC3 54 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RAB9AP51151 201 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 C10orf128Q5T292 105 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 HTN1P15515 57 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 MFAP4P55083 255 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 UCP3P55916 312 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TMEM45BQ96B21 275 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ODAMA1E959 279 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SOSTQ9BQB4 213 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 GP6Q9HCN6 339 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PCOLCEQ15113 449 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TMEM186Q96B77 213 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 GFRA1P56159 465 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 DCAF12L2Q5VW00 463 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ZNF383Q8NA42 475 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 Q96M66 194 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SCN4AP35499 1836 aa11.27□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 A6NJY4 79 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 P2RY4P51582 365 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 MYO9BQ13459 2157 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 DIRC3C9JPN6 131 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 SP9P0CG40 484 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ZNF137PP52743 207 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 M0R3E3 92 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 HLA-DQA1P01909 254 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 AMY1AP04745 511 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 TM4SF20Q53R12 229 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 TMEM140Q9NV12 185 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ZNF738Q8NE65 137 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 GPR146Q96CH1 333 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 AMELYQ99218 206 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 NKX2-8O15522 239 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 OR2A4O95047 310 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 S1PR2O95136 353 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 FGFRL1Q8N441 504 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 OR2A7Q96R45 310 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 MCM3APO60318 1980 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 UBE2L6O14933 153 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ZNF250P15622 560 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 MFAP2P55001 183 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ZNF146Q15072 292 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 OR9G1Q8NH87 305 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 SMIM8Q96KF7 97 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 NUBP1P53384 320 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 RUNX1Q01196 453 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 COPS9Q8WXC6 57 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS1-205ENST00000419504 CD74P04233 296 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms