RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8U1Q8NH10 309 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPX8Q8TED1 209 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABHD14BQ96IU4 210 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXTL2Q9UBQ6 330 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2W1Q9Y3N9 320 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF114Q9Y508 228 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa12.21□□□□□ -0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R46P59540 309 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAPC3Q92966 411 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF747Q9BV97 191 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2D2Q9H210 308 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF702PQ9H963 129 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTDSP2O14595 271 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUSC2O75896 110 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT45A6P0DMU7 189 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT45A5P0DMU8 189 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT45A7P0DMV0 189 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5H8P0DN80 308 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCVRNP35243 200 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PROK1P58294 105 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK10Q15131 360 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAX1Q8IWV1 398 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5AN1Q8NGI8 311 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF5Q99942 180 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF150Q9ULK6 438 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBBP9O75884 186 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLCAPP62952 87 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNF4GQ14541 408 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSMO1Q15800 293 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF645Q8N7E2 425 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCFD2Q8NI22 146 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP27Q9H306 513 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WASHC3Q9Y3C0 194 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEIS3P1A6NDR6 274 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YJW9 148 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PROP1O75360 226 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOA2P02652 100 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMY1AP04745 511 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMY2AP04746 511 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTBP60709 375 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBLN7Q53RD9 439 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTBL2Q562R1 376 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OVCH2Q7RTZ1 564 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDPNQ86YL7 162 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R1X1 148 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTDSPLO15194 276 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPYP01298 95 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRASP10301 218 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBPP20226 339 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCGR2CP31995 323 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THBS3P49746 956 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA11PQ4W5N1 156 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHRS11Q6UWP2 260 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM131AQ6UXB0 335 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5H2Q8NGV7 314 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BORCS5Q969J3 196 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABHD1Q96SE0 405 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLSCR3Q9NRY6 295 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GABARAPH6UMI1 98 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBX3Q13185 183 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMDQ15546 238 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N9W7 124 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF383Q8NA42 475 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB34Q8NCN2 500 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPBQ8NG41 125 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.16□□□□□ -0.46
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