RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 BLOC1S1P78537 153 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 NRGNQ92686 78 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 UHRF2Q96PU4 802 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 HSF4Q9ULV5 492 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 F6UZH7 168 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ORM2P19652 201 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LOXL3P58215 753 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LYZP61626 148 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 OR5R1Q8NH85 324 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RHOFQ9HBH0 211 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM131Q92545 1883 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A0G2JK05 382 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 C9orf170A2RU37 121 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SRRM5B3KS81 715 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 FGF7P21781 194 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 HIST3H3Q16695 136 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LCN15Q6UWW0 184 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 MMD2Q8IY49 270 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 BORCS7Q96B45 105 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 K7EQM0 130 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 DKK1O94907 266 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 HPRT1P00492 218 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 IGKV1D-33P01593 117 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 IGKV1-33P01594 117 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 HLA-DQB1P01920 261 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A6P12236 298 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SRD5A1P18405 259 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 PPOXP50336 477 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TAS2R45P59539 299 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF843Q8N446 348 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TPPP3Q9BW30 176 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB18Q9NP72 206 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1W2PRX2 142 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF250P15622 560 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ARL16Q0P5N6 197 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 DTD1Q8TEA8 209 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RABAC1Q9UI14 185 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SIGLEC5O15389 551 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SYNGR2O43760 224 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 OR10J4P0C629 311 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 UNC119Q13432 240 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 OPCMLQ14982 345 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM219AQ8IW50 185 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB40CQ96S21 281 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 MTORP42345 2549 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GVG6 124 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 SOD3P08294 240 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 TDGF1P3P51864 188 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 GUCA2BQ16661 112 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 LURAP1Q96LR2 239 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM3-201ENST00000361320 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms