RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RRASP10301 218 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C4BPBP20851 252 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RFX2P48378 723 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RHOVQ96L33 236 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF75AQ96N20 296 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DUX3Q96PT4 197 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MMP27Q9H306 513 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 J3QR06 171 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R20P59543 309 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NSG2Q9Y328 171 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.65□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 PXT1Q8NFP0 134 aa3.65□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.65□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 IGKV3-20P01619 116 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR8U8P0C7N1 319 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 S100ZQ8WXG8 99 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 GALP22466 123 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DRB3P79483 266 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HTD2P86397 168 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LSAMPQ13449 338 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PMS2P11Q13670 270 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MEF2DQ14814 521 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 Q8WTZ3 238 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PRRT1Q99946 306 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ABCG5Q9H222 651 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 NBR2O15453 112 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 FGFRL1Q8N441 504 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK15Q9H427 330 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
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