RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 C1RLQ9NZP8 487 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RBBP9O75884 186 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CD3DP04234 171 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 BRS3P32247 399 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 S100A5P33763 92 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RCVRNP35243 200 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 GPR12P47775 334 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LSAMPQ13449 338 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 DYRK1AQ13627 763 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 HES1Q14469 280 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF221Q9UK13 617 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RNF212BA8MTL3 300 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 M0R1X1 148 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TPPPO94811 219 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PPYP01298 95 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 AMY1AP04745 511 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 AMY2AP04746 511 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FXYD4P59646 89 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 BLCAPP62952 87 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM17Q86X19 198 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF383Q8NA42 475 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 S1PR3Q99500 378 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00473A8K010 186 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CTDSPLO15194 276 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CNTFRP26992 372 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ETV6P41212 452 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 F2RL1P55085 397 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R46P59540 309 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PYDC2Q56P42 97 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZSV7 163 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 Q8N6K4 173 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 BATF3Q9NR55 127 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 H0YJW9 148 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1-16P04430 117 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM11P17152 192 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CD1BP29016 333 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGDIBP52566 201 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ACTBP60709 375 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ACTG1P63261 375 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 EBI3Q14213 229 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM63Q969Q1 353 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PLXNB1O43157 2135 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 DNHD1Q96M86 4753 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR5H14A6NHG9 310 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TXNL1O43396 289 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TNFSF12O43508 249 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PEX14O75381 377 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CRYBA1P05813 215 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FAM106CPP0CH98 169 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 HKR1P10072 659 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 Q8N402 240 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SRRQ9GZT4 340 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 GHITMQ9H3K2 345 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 GAB2Q9UQC2 676 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR2F2O95006 317 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RAB3DO95716 219 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 MOSP00540 346 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CD74P04233 296 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF735P0CB33 412 aa7.23□□□□□ -1.25
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