RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 HS3ST5Q8IZT8 346 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 CKLFQ9UBR5 152 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 CDRT1O95170 752 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FOLR2P14207 255 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 BDKRB2P30411 391 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 OR3A3P47888 321 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF45Q02386 682 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF85Q03923 595 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5G2Q06055 141 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 DYRK1AQ13627 763 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM177Q53S58 311 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 PDPNQ86YL7 162 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 SYS1Q8N2H4 156 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR148Q8TDV2 347 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf36Q96KX1 117 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM107BQ9H098 131 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf70A6NJV1 201 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf94C9JXX5 98 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 G3V2T6 193 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YJW9 148 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R129 80 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS9O00182 355 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTL6BO94805 426 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9G9P0C7N8 305 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A6P0DMU7 189 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A5P0DMU8 189 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A7P0DMV0 189 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT3P21217 361 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DAPP51397 102 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A2Q01362 244 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB135Q30KP9 77 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TM4SF20Q53R12 229 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA24Q86W54 205 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GAPTQ8N292 157 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MARC2Q969Z3 335 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF221Q9UK13 617 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GAB2Q9UQC2 676 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB1BP1O14713 200 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 XRCC3O43542 346 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP6O75344 327 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SC5DO75845 299 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SCTP09683 121 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CBLN1P23435 193 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX2P48431 317 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOGP84095 191 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FLOT2Q14254 428 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GNMTQ14749 295 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF529Q6P280 563 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 NECAP1Q8NC96 275 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 NSL1Q96IY1 281 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL17Q9UF56 701 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms