RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRPC1-201ENST00000273482 COL10A1Q03692 680 aa14.62□□□□□ -0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.61□□□□□ -0.07
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