RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 ATG101Q9BSB4 218 aa9.91□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 RBKSQ9H477 322 aa9.91□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 H0Y980 276 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 PDE6DO43924 150 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 ELOBQ15370 118 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 DTD1Q8TEA8 209 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 RPEL1Q2QD12 228 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM27BQ5VT28 67 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 HES7Q9BYE0 225 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2D2Q9H210 308 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 CA6P23280 308 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 OR3A1P47881 315 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 PCP4P48539 62 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 C1QL4Q86Z23 238 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLSTN3-201ENST00000266546 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.9□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 DBX1A6NMT0 343 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TOX4O94842 621 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 GNG4P50150 75 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 FABP6P51161 128 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 FHL1Q13642 323 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 MST1LQ2TV78 715 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PRR27Q6MZM9 219 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 Q8IYB0 196 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR73Q6P4I2 378 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 OR4C12Q96R67 309 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 S1PR3Q99500 378 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 SNURFLB1AK76 121 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 K7N7A8 449 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFB7P17568 137 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PAFAH1B2P68402 229 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PLAURQ03405 335 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 RFESDQ8TAC1 157 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TM2D1Q9BX74 207 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 C9JQL5 133 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 KBTBD11O94819 623 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 IER3P46695 156 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 CCL20P78556 96 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR146Q96CH1 333 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.89□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 OR5B21A6NL26 309 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 MAGEA5P43359 124 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 RHOBP62745 196 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PIP4P1Q86T03 277 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PARLQ9H300 379 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A0A6YYD4 124 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 OR10J4P0C629 311 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 COL10A1Q03692 680 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF596Q8TC21 504 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ABHD3Q8WU67 409 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 TINAGQ9UJW2 476 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 DIRC3C9JPN6 131 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 SIAH2O43255 324 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ZIC3O60481 467 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 CXCL1P09341 107 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 PTGDSP41222 190 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 ICAM4Q14773 271 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC35E1Q96K37 410 aa9.88□□□□□ -0.83
CLSTN3-201ENST00000266546 WFDC1Q9HC57 220 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms