RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ODAMA1E959 279 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM189A5PLL7 270 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 F5H697 171 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 PDCD1Q15116 288 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 GFRA1P56159 465 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 RTP5Q14D33 572 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 CD99P14209 185 aa7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 DANCRP0C864 163 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 C8orf88P0DMB2 117 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 Q6AWC8 147 aa7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-201ENST00000261266 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 CA7P43166 264 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 PPOXP50336 477 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5G2Q06055 141 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 HERPUD1Q15011 391 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 DOK5Q9P104 306 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.75□□□□□ -1.17
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