RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OCEL1Q9H607 264 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 JPT1Q9UK76 154 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 A0A1W2PPE2 198 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 A0A1W2PR64 198 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 A0A1W2PRV1 198 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 IGLV1-47P01700 117 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 CD74P04233 296 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TAS2R46P59540 309 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 Q6ZS49 121 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 STX12Q86Y82 276 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR8H3Q8N146 312 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 UPRTQ96BW1 309 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 PRR13Q9NZ81 148 aa8.8□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TNCP24821 2201 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TOR1AO14656 332 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 S100A12P80511 92 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 AJUBAQ96IF1 538 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 MMP28Q9H239 520 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 LYRM1O43325 122 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 YPEL1O60688 119 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TUSC2O75896 110 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 PGAM2P15259 253 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 EPHA1P21709 976 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 GNRHRP30968 328 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 ZNF626Q68DY1 528 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 POC5Q8NA72 575 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR9G1Q8NH87 305 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 YPEL2Q96QA6 119 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 CCDC32Q9BV29 185 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.79□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 NPFFO15130 113 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 CIDEAO60543 219 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 IGHV1-69P01742 117 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR51H1Q8NH63 302 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.78□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 A0A087X0M5 115 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 A0A1B0GX30 115 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 LINC00473A8K010 186 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 ODF3BA8MYP8 253 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 RLN1P04808 185 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 SPNP16150 400 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 UBE2E1P51965 193 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 LGALS4P56470 323 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 HNF4GQ14541 408 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 DRAM1Q8N682 238 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 NANPQ8TBE9 248 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.77□□□□□ -1
TTPA-201ENST00000260116 PF4V1P10720 104 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 RPA2P15927 270 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 M6PRP20645 277 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 GATA3P23771 443 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 HTR1DP28221 377 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 GPR12P47775 334 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 HERV-K104P61576 105 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 FAM209BQ5JX69 171 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 TERB2Q8NHR7 220 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTPA-201ENST00000260116 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms