RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM171Q8WVE6 324 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAMF9Q96A28 289 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2H1Q9GZK4 316 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 S100GP29377 79 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC12P31275 282 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R30P59541 319 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NRN1LQ496H8 165 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR7LQ8NHP1 331 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDND2Q8NHS1 167 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 Q9N2K0 584 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP9Q99996 3911 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNLT3P51808 116 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 BRICD5Q6PL45 260 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MDP1Q86V88 176 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM1Q8IZ96 169 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF150Q9ULK6 438 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 H0Y980 276 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM20O43506 726 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TUSC2O75896 110 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG4Q00888 419 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIN3Q5JUX0 258 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF611Q8N823 705 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 DOK5Q9P104 306 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GV50 99 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NAPSAO96009 420 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF92Q03936 586 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF674Q2M3X9 581 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF11Q5DX21 431 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZPA2 131 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 STX12Q86Y82 276 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGCQ92535 297 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT5BQ9H1J7 359 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT2P09544 360 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 HAGHQ16775 308 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MPV17LQ2QL34 196 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8WTZ3 238 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CD40P25942 277 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DRB3P79483 266 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA5P01569 189 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 OMGP23515 440 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NPBWR2P48146 333 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA6P56556 154 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2B11Q5JQS5 317 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 LURAP1Q96LR2 239 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP5LA4QPB2 252 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A26Q70HW3 274 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB40CQ96S21 281 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NGBQ9NPG2 151 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP24Q9Y5R2 645 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GU03 582 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 YIF1AO95070 293 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3-15P01624 115 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CECR9P0C854 216 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF12P61328 243 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00596Q86U02 117 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 GAPTQ8N292 157 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SHISA9B4DS77 424 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YL77 283 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ODF3L1Q8IXM7 274 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RX4Q99571 388 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 OBP2BQ9NPH6 170 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R2P9O14990 202 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST1O43916 411 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CD3EP07766 207 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RND2P52198 227 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM108Q6UXF1 575 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 COLCA1Q6ZS62 124 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 DSCAMO60469 2012 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF727A8MUV8 499 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV1-44P01699 117 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PYY3Q5JQD4 70 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CALHM1Q8IU99 346 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGT1Q9H0U3 335 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PLK3Q9H4B4 646 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 USF3Q68DE3 2245 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.07■■□□□ 1.12
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