RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 BIVMQ86UB2 503 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SPINK2P20155 84 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ACP1P24666 158 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 OR8I2Q8N0Y5 310 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CT55Q8WUE5 264 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RPRMQ9NS64 109 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 R4GN57 208 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 IGKV3-11P04433 115 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SMOC1Q9H4F8 434 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 KLK10O43240 276 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SNAI3Q3KNW1 292 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM108Q6UXF1 575 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 PAXXQ9BUH6 204 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RNF126Q9BV68 326 aa16■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CLDN14O95500 239 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 C10orf128Q5T292 105 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM45BQ96B21 275 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 HARBI1Q96MB7 349 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 MAGEA5P43359 124 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TNXAQ16473 311 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RNF7Q9UBF6 113 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 OR51B2Q9Y5P1 312 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 OR1L1Q8NH94 360 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SELENOTP62341 195 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 MDP1Q86V88 176 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 AICDAQ9GZX7 198 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 OR2H2O95918 312 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 HES7Q9BYE0 225 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 MGST3O14880 152 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 STAG3L2P0CL84 134 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 DEFB124Q8NES8 71 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 UBE2CO00762 179 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RHBDL1O75783 438 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 COX5BP10606 129 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SPSB4Q96A44 273 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 APC2O95996 2303 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCL4P13236 92 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CEACAM3P40198 252 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 OR4A47Q6IF82 309 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 AMY1AP04745 511 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 FOLR2P14207 255 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 UCP1P25874 307 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 PRDX2P32119 198 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA13-201ENST00000222753 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 C21orf140B9A014 251 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 FOXC1Q12948 553 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 LYPD3O95274 346 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 MIC13Q5XKP0 118 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SFRP2Q96HF1 295 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SVILO95425 2214 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 M0R296 226 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF735P0CB33 412 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 COL10A1Q03692 680 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 HES3Q5TGS1 186 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 CCL17Q92583 94 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA13-201ENST00000222753 SLC35B1P78383 322 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms