RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RDH5	Q92781	318 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	PYURF	Q96I23	114 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DOK5	Q9P104	306 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RARRES3	Q9UL19	164 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	CEP250	Q9BV73	2442 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ORC5	O43913	435 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	SOX14	O95416	240 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	CLPS	P04118	112 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	FGF2	P09038	288 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GNLY	P22749	145 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	SHC1	P29353	583 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RBP2	P50120	134 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	CDK5	Q00535	292 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GINS1	Q14691	196 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	OTP	Q5XKR4	325 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00477	Q96M19	166 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DUSP21	Q9H596	190 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		5.68	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340		G3V2T6	193 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RAB5A	P20339	215 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GPR183	P32249	361 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	CLINT1	Q14677	625 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	NSDHL	Q15738	373 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	MICA	Q29983	383 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF404	Q494X3	552 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RAB43	Q86YS6	212 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	FGF11	Q92914	225 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM203	Q969S6	136 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	PCSK5	Q92824	1860 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A1W2PRE2	83 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF724	A8MTY0	619 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340		F6UB75	175 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNHIT1	O43257	154 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	EPPIN	O95925	133 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	IFI6	P09912	130 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	TAS2R43	P59537	309 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC35A2	P78381	396 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GAGE5	Q13069	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GAGE6	Q13070	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF154	Q13106	437 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZFP69	Q49AA0	526 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF626	Q68DY1	528 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	OPN5	Q6U736	354 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	PIP4P1	Q86T03	277 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	SVOPL	Q8N434	492 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF614	Q8N883	585 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DOHH	Q9BU89	302 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	RGS5	O15539	181 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MFSD8-223	ENST00000641340	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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