RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MOB3BQ86TA1 216 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DRAM1Q8N682 238 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MALSU1Q96EH3 234 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SSX3Q99909 188 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB9BQ9NP90 201 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1W2PPI3 338 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H3BUX3 64 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TUSC2O75896 110 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF735P0CB33 412 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IER3P46695 156 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FXYD4P59646 89 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BPIFB3P59826 476 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BAMBIQ13145 260 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q8N402 240 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TEX29Q8N6K0 151 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPEQ96AT9 228 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RITA1Q96K30 269 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.44□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5H14A6NHG9 310 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSD17B6O14756 317 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TIMM23O14925 209 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV2-14P01704 120 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD74P04233 296 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBP1P09467 338 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CTXN2P0C2S0 81 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CT45A6P0DMU7 189 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CT45A5P0DMU8 189 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CT45A7P0DMV0 189 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GPR12P47775 334 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TAS2R46P59540 309 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DYRK1AQ13627 763 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HNF4GQ14541 408 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q3ZCU0 254 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM219Q86XT9 240 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR56B4Q8NH76 319 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOMM40LQ969M1 308 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRIM63Q969Q1 353 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2D2Q9H210 308 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0R1X1 148 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ITGB1BP1O14713 200 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB3DO95716 219 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPYP01298 95 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 30.5
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPAN5P62079 268 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF383Q8NA42 475 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFHR4Q92496 578 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHIAQ9BZP6 476 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF221Q9UK13 617 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COL6A5A8TX70 2615 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TNCP24821 2201 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms