RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL19Q99731 98 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 LRBAP50851 2863 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CCSO14618 274 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RBP4P02753 201 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 NFYBP25208 207 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GNMTQ14749 295 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf68Q2NKX9 166 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SP6Q3SY56 376 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF12L2Q5VW00 463 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 LYPD2Q6UXB3 125 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf24Q7Z6I8 188 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC22AQ96IW7 307 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 C18orf12Q96KH6 178 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TP53RKQ96S44 253 aa18.71■□□□□ 0.59
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CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GW55 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LYNX1G3V0Z9 82 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB29O14966 203 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L2P0CJ85 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L3P0CJ86 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L4P0CJ87 422 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L5P0CJ88 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L6P0CJ89 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L7P0CJ90 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-43DP0DP04 118 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LYNX1P0DP58 116 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A4P12235 298 aa18.7■□□□□ 0.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 VDAC1P21796 283 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LOXL3P58215 753 aa18.7■□□□□ 0.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM200BQ69YZ2 307 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 OR51H1Q8NH63 302 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 S1PR3Q99500 378 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 C19orf12Q9NSK7 152 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DUX4Q9UBX2 424 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 A1L4Q6 167 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SMLR1H3BR10 107 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFSF12O43508 249 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAP1O75689 374 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CLDN1O95832 211 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 IL3RAP26951 378 aa18.69■□□□□ 0.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf31Q8N9H6 132 aa18.69■□□□□ 0.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa18.69■□□□□ 0.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 CTSZQ9UBR2 303 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPB11Q9Y547 144 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 L7N2F9 121 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 OVOL3O00110 214 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf87Q6NUJ2 197 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD14BQ96IU4 210 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF150Q9ULK6 438 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DSCAMO60469 2012 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ROS1P08922 2347 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ST8SIA5O15466 376 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A6P12236 298 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM219AQ8IW50 185 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35G3Q8N808 338 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF14Q92956 283 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 GON7Q9BXV9 100 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CACFD1Q9UGQ2 172 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PKDREJQ9NTG1 2253 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0D9SG52 128 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PPR1 153 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFS8O00217 210 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LIPFP07098 398 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 THBS3P49746 956 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF546Q86UE3 836 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf46Q8TAG6 207 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 AIFM2Q9BRQ8 373 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SLA2Q9H6Q3 261 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA12Q86UK0 2595 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TOR1AO14656 332 aa18.65■□□□□ 0.58
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