RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 LPCAT4Q643R3 524 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 BTNL8Q6UX41 500 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PXT1Q8NFP0 134 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR1L1Q8NH94 360 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GIPC3Q8TF64 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 FEVQ99581 238 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 S100A13Q99584 98 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RNF5Q99942 180 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RNF126Q9BV68 326 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ALG8Q9BVK2 526 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 JPT1Q9UK76 154 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF320A2RRD8 509 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MPTX1A8MV57 137 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 LGALS9O00182 355 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SULT1B1O43704 296 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MT-ND4P03905 459 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CPEP16870 476 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 EDN2P20800 178 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CDK5Q00535 292 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PSG5Q15238 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR4A47Q6IF82 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00596Q86U02 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR2T29Q8NH02 315 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR4K15Q8NH41 348 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 C18orf15Q96N68 181 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MLXQ9UH92 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GNG8Q9UK08 70 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RAB29O14966 203 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SULT1C4O75897 302 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OSMP13725 252 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V1B2P21281 511 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 EPHA2P29317 976 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RHOGP84095 191 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MPV17LQ2QL34 196 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SPATS1Q496A3 300 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR5B3Q8NH48 314 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR52N1Q8NH53 320 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CSTL1Q9H114 145 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 HRH4Q9H3N8 390 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 IFT22Q9H7X7 185 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PPP5D1E7EU14 171 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 H0YJW9 148 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 YPEL1O60688 119 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR2C1O95371 312 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 AMBPP02760 352 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GSTT2P0CG29 244 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GSTT2BP0CG30 244 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 APELAP0DMC3 54 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ADMP35318 185 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V1E1P36543 226 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GYS2P54840 703 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GK3PQ14409 553 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GNMTQ14749 295 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SSX6Q7RTT6 188 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PELI1Q96FA3 418 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC140Q96MF4 163 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms