RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC31A2	O15432	143 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TXNL1	O43396	289 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TUSC2	O75896	110 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FSHB	P01225	129 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FBP1	P09467	338 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SRD5A1	P18405	259 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	S100G	P29377	79 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ECI1	P42126	302 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF134	P52741	427 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	DEFA1	P59665	94 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	DEFA3	P59666	94 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	UTF1	Q5T230	341 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78	1e-6	■■■□□ 16.8
ABCD4-223	ENST00000555904	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OOSP1	A8MZH6	123 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	HSD17B6	O14756	317 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SSX2	Q16385	188 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC6A7	Q99884	636 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A0U1RQK1	487 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PGAM2	P15259	253 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF137P	P52743	207 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PLA1A	Q53H76	456 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LYRM1	O43325	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	BRS3	P32247	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	REG1B	P48304	166 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MSMO1	Q15800	293 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904		M0R1X1	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	UCP3	P55916	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	CBX3	Q13185	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	ASAH1	Q13510	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCD4-223	ENST00000555904	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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