RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A45Q8N413 288 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-210ENST00000551525 PRSS50Q9UI38 385 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 LRP12Q9Y561 859 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FABP5Q01469 135 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.48□□□□□ -1.53
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