RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GRSF1-208	ENST00000545193	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GRSF1-208	ENST00000545193	SH2D1B	O14796	132 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	RUNX1	Q01196	453 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.21	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	MPPED1	O15442	326 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	LY86	O95711	162 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BQ15	152 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	WNT9B	O14905	357 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	RND3	P61587	244 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	EPHA1	P21709	976 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	GNRHR	P30968	328 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB39B	Q96DA2	213 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PFDN5	Q99471	154 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ADAM20	O43506	726 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TUSC2	O75896	110 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	HAND1	O96004	215 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GV90	55 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM50A	O95807	157 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	IFNA17	P01571	189 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CCKAR	P32238	428 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	GLRX	P35754	106 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	UCN	P55089	124 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFA6	P56556	154 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	YPEL4	Q96NS1	127 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TNFSF12	O43508	249 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	CXCL1	P09341	107 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	DYNLT3	P51808	116 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF266	Q14584	549 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	GAPT	Q8N292	157 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	IFITM10	A6NMD0	228 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	PSPN	O60542	156 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2K	P61086	200 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	VAMP2	P63027	116 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BP45	60 aa		13.16	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	HSD17B6	O14756	317 aa		13.16	□□□□□ -0.3
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.16	□□□□□ -0.3

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