RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.46□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLN6Q9NWW5 311 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL15A6NJ78 407 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BNX3 289 aa7.45□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A5P0DMU8 189 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A7P0DMV0 189 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DMBP28068 263 aa7.45□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.45□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX19Q8N4C7 294 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2C3Q8N628 320 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GHSRQ92847 366 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C18orf15Q96N68 181 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPER1Q99527 375 aa7.45□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHB2Q99623 299 aa7.45□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUSC2O75896 110 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S1PR2O95136 353 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDRT1O95170 752 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-ND2P03891 347 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53I3Q53FA7 332 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.44□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T29Q8NH02 315 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIPC3Q8TF64 312 aa7.44□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.44□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPTX1A8MV57 137 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YJW9 148 aa7.43□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST8SIA5O15466 376 aa7.43□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSMP13725 252 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF124Q15973 351 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf183Q5T699 404 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZRM9 215 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.43□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSTL1Q9H114 145 aa7.43□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.43□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGALS9O00182 355 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT1B1O43704 296 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1-16P04430 117 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCTP09683 121 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPEP16870 476 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MC5RP33032 325 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF585BQ52M93 769 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PXT1Q8NFP0 134 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52N1Q8NH53 320 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNT14Q96FL9 552 aa7.42□□□□□ -1.22
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