RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 PLA1AQ53H76 456 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 FBLN7Q53RD9 439 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ABHD1Q96SE0 405 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 AGMATQ9BSE5 352 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 C16orf95Q9H693 158 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 H3BUX3 64 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB25P24278 435 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 DYNLT3P51808 116 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ZNF137PP52743 207 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 CNIH2Q6PI25 160 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 MCFD2Q8NI22 146 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 GPX8Q8TED1 209 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 SNAPC3Q92966 411 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 SOSTQ9BQB4 213 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.91□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 A0A1W2PPI3 338 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ITGB1BP1O14713 200 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 RGS5O15539 181 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 DIRAS3O95661 229 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 FCER2P06734 321 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 NAT1P18440 290 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 PRSS3P35030 304 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 LY6EQ16553 131 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 RDH8Q9NYR8 311 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PUF60-218ENST00000531995 OOSP1A8MZH6 123 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 BET1O15155 118 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 ST8SIA5O15466 376 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 PROP1O75360 226 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 TSPAN9O75954 239 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 RGS11O94810 467 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 TPPPO94811 219 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 TNFSF8P32971 234 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CEACAM3P40198 252 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 BEST4Q8NFU0 473 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 OR5R1Q8NH85 324 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CFHR4Q92496 578 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.89□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 A6NDX4 124 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CSF1P09603 554 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CD24P25063 80 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CBX5P45973 191 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 REG1BP48304 166 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 LYG1Q8N1E2 194 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 RPEQ96AT9 228 aa14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 HSD17B6O14756 317 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 HSPA12AO43301 675 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 LPLP06858 475 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 OR3A3P47888 321 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 RAB7AP51149 207 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 TOMM40LQ969M1 308 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.87□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 SULT1C2O00338 296 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 LANCL1O43813 399 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CTXN2P0C2S0 81 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 OR8H3Q8N146 312 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 DRAM1Q8N682 238 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 OR52I2Q8NH67 350 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 RNF150Q9ULK6 438 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 TCF19Q9Y242 345 aa14.86□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 G3V4G9 280 aa14.85□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 PLXNB1O43157 2135 aa14.85□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 CHST1O43916 411 aa14.85□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 TUSC2O75896 110 aa14.85□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PUF60-218ENST00000531995 IL3RAP26951 378 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms