RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.34□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.34□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GNG8Q9UK08 70 aa3.34□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.34□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.34□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.34□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC182A6NF36 153 aa3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 GABRR1P24046 479 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 MS4A2Q01362 244 aa3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 OSR2Q8N2R0 312 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PHYHIPQ92561 330 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TOMM40LQ969M1 308 aa3.33□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR5M11Q96RB7 305 aa3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 CST11Q9H112 138 aa3.33□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GTI1 187 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ODAMA1E959 279 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 A6NDX4 124 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 DEGS1O15121 323 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PRKYO43930 277 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ENTPD6O75354 484 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 GPX5O75715 221 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RBBP9O75884 186 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV1-47P01700 117 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV2-11P01706 119 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF44P15621 663 aa3.32□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 CD1BP29016 333 aa3.32□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 DAPP51397 102 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CBX3Q13185 183 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RSU1Q15404 277 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 KISS1Q15726 138 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SPRNQ5BIV9 151 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 MMD2Q8IY49 270 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PNKDQ8N490 385 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00311Q8N616 119 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR8U1Q8NH10 309 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR52N1Q8NH53 320 aa3.32□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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