RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CLUHO75153 1309 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ZNF532Q9HCE3 1301 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ABCC1P33527 1531 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 NUP188Q5SRE5 1749 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 FADS1O60427 444 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 GTF2F2P13984 249 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MPIP34949 423 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 ELP2Q6IA86 826 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TCF23Q7RTU1 214 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 BORCS5Q969J3 196 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 PHB2Q99623 299 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TRABDQ9H4I3 376 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 GLTPQ9NZD2 209 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ARL5AQ9Y689 179 aa3.12□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 M0QZK8 103 aa3.11□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF9Q07011 255 aa3.11□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 MAPK14Q16539 360 aa3.11□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 DOLPP1Q86YN1 238 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.11□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 MAST1Q9Y2H9 1570 aa3.11□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 NUP155O75694 1391 aa3.11□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 WDR90Q96KV7 1748 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ATP10BO94823 1461 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 GTF3C1Q12789 2109 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 UNC13BO14795 1591 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 K7EQS6 105 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 IGKV1-39P01597 117 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 APOC1P02654 83 aa3.1□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 IGKV1D-39P04432 117 aa3.1□□□□□ -1.91
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