RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 ARF6P62330 175 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 HTD2P86397 168 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PAX2Q02962 417 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FOXE3Q13461 319 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 ASAH1Q13510 395 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 DYRK1AQ13627 763 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR56B4Q8NH76 319 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 MMP26Q9NRE1 261 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PRX2 142 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 J3QLI3 93 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 LYRM1O43325 122 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TOX4O94842 621 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TGFAP01135 160 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FCGR2CP31995 323 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 RFX2P48378 723 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 GNG10P50151 68 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TSPAN5P62079 268 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 LEAP2Q969E1 77 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TOMM40LQ969M1 308 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PRRT1Q99946 306 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 SIRPDQ9H106 197 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 RDH8Q9NYR8 311 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 AUP1Q9Y679 476 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 MAST4O15021 2626 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TOR1AO14656 332 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TUSC2O75896 110 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 MMP23AO75900 390 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PPYP01298 95 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-7P01780 117 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PGAM2P15259 253 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 AADACP22760 399 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PRTN3P24158 256 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 CD34P28906 385 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 CEACAM6P40199 344 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 RAB7AP51149 207 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 LOXL3P58215 753 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FXYD4P59646 89 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 IFITM3Q01628 133 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 KLRD1Q13241 179 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 Q3ZCU0 254 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PNKDQ8N490 385 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 Q8N7P7 452 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 POC5Q8NA72 575 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 OR9G1Q8NH87 305 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 ENKURQ8TC29 256 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 MOB3AQ96BX8 217 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 C18orf12Q96KH6 178 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 TBX15Q96SF7 602 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 SLC6A7Q99884 636 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-218ENST00000487565 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms