RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 LINC00311Q8N616 119 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 OR52L2PQ8NGH6 319 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 DIABLOQ9NR28 239 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.29□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 RGS11O94810 467 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 SOX6P35712 828 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 HTD2P86397 168 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 EBI3Q14213 229 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10.28□□□□□ -0.76
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HPS1-211ENST00000478087 GALMQ96C23 342 aa10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 ABCG5Q9H222 651 aa10.28□□□□□ -0.76
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HPS1-211ENST00000478087 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HPS1-211ENST00000478087 A0A0B4J203 849 aa10.27□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 PF4V1P10720 104 aa10.27□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 TALDO1P37837 337 aa10.27□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.27□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.26□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 FGF16O43320 207 aa10.25□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.25□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 DUX3Q96PT4 197 aa10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 YPEL2Q96QA6 119 aa10.25□□□□□ -0.77
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HPS1-211ENST00000478087 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 GHITMQ9H3K2 345 aa10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 DNAH9Q9NYC9 4486 aa10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 COL7A1Q02388 2944 aa10.25□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 TRDCB7Z8K6 153 aa10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 ITGB1BP1O14713 200 aa10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 XRCC3O43542 346 aa10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 MOSP00540 346 aa10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 PF4P02776 101 aa10.24□□□□□ -0.77
HPS1-211ENST00000478087 FCGR3AP08637 254 aa10.24□□□□□ -0.77
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