RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 NACAE9PAV3 2078 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf66A4D0T2 115 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PLCH2O75038 1416 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PDYNP01213 254 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV3-27P01718 113 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 GUSBP08236 651 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK2P24941 298 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 G0S2P27469 103 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP2K4P45985 399 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF616Q08AN1 781 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT5Q11128 374 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PMAIP1Q13794 54 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PDGFRLQ15198 375 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 SBSNQ6UWP8 590 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N9L7 120 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 AP3S1Q92572 193 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PYURFQ96I23 114 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB26Q9ULW5 256 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL5AQ9Y689 179 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087WUJ7 227 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 DISC1C4P0D8 188 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 HAND1O96004 215 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TRGV3P03979 118 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 GYPCP04921 128 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM228BP0C875 321 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 CGB3P0DN86 165 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 CGB7P0DN87 165 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 CD79AP11912 226 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEA12P43365 314 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6P435 159 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PXT1Q8NFP0 134 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2D2Q9H210 308 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM238C9JI98 176 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R381 172 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 FSTL3O95633 263 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1D-12P01611 117 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10J1P30954 320 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 CA7P43166 264 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM33P57088 247 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM201AQ5SY85 155 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB125Q8N687 156 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52E6Q96RD3 313 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PHB2Q99623 299 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.71□□□□□ -1.81
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GV50 99 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MWP4 228 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 MT-CO2P00403 227 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1D-33P01593 117 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-33P01594 117 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 OPN1SWP03999 348 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL1P22362 96 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 BSPH1Q075Z2 132 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 S4R3C0 116 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP205Q92621 2012 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NED7 52 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV7-43P04211 117 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 CST2P09228 141 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 GZMMP51124 257 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 DAPP51397 102 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 LRP11Q86VZ4 500 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T27Q8NH04 317 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 RMI2Q96E14 147 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms